Handlung:

Der unehrenhaft entlassene Kämpfer einer Spezialeinheit, Joaqim 'Joe' Kommandowski - Codename Commando - ist eine Ein-Mann-Armee mit dem Waffenarsenal eines Kleinstaates. In geheimer Mission kämpft er gegen eine 10.000-Mann-Armee eines Kleinstaates um sie daran zu hindern eine Atombombe in einem noch kleinerem Staat zu zünden.

Der Oberbefehlshaber jenes Schurkenstaates, General Waste, möchte auf diese Art und Weise die Wertvollen Rohstoffvorkommen des kleinen Nachbarlandes vernichten, die laut seiner perfiden Ideologie die Wurzel allen Übels ist. Das er sich bei der geplanten Aktion nebenbei auch noch bereichert in dem die erbeuteten Rohstoffe gewinnbringend an andere Schurkenstaaten verkauft, ist fest einkalkuliert.

Und so muss Joe tief hinter die feindlichen Linien gelangen um die angreifende Armee aufzuhalten und General Waste das Handwerk zu legen. Auf dem Weg dorthin macht er alles kaputt, was ihm in die Quere kommt: Waffenfabriken, Foltergefängnisse, Apfelplantagen, Nukular-Anreicherungsanlagen, uvm.
Stets dabei an seiner Seite ist sein Maschinengewehr "Miss Bämm", sowie ein Rucksack voller Sprengstoff.

Als Joe dabei ist, allerhand Feinde abzuknallen, während um ihn herum alles explodiert, tappt er in die Falle des Generals, der davon überzeugt ist, seinen Widersacher überlistet zu haben. Doch genau das hatte Joe von vornherein so geplant...